Análise genômica dos isolados clínicos de Pseudomonas aeruginosa comportando o Sistema CRISPR/Cas

Abstract

Pseudomonas aeruginosa é um patógeno oportunista capaz de infectar pacientes queimados ou imunocomprometidos em hospitais e ambientes de assistência à saúde. Uma das principais causas de infeções hospitalares causadas por P. aeruginosa é devido a sua resistência intrínseca aos antimicrobianos e produção de biofilme. O sistema CRISPR/Cas é definido como um mecanismo de defesa de procariotos contra elementos genéticos móveis (MGEs), composto por um loco CRISPR, formado por sequências repetitivas intercaladas por espaçadores e genes cas. O trabalho teve como objetivo uma análise de isolados de P. aeruginosa comportando o sistema CRISPR/Cas. Dos 12 isolados analisados, 83% abrigam o sistema tipo I-F e 17% o sistema tipo I-E. Os espaçadores encontrados para o tipo I- F correspondem a sequências de bacteriófagos e plasmídeos. Foram observados 282 espaçadores nos isolados, onde 149 sequências foram relatadas pela primeira vez. A presença de genes anti-CRISPR e profagos inseridos nos genomas desses isolados, sugere uma pressão seletiva entre fagos e bactérias. A presença dos STs compartilhados entre setores e entre hospitais permitiu traçar uma rota de disseminação desses isolados. Entretanto, a aplicação do loco CRISPR como uma ferramenta molecular para tipagem, se mostrou ineficaz em P. aeruginosa. Os resultados fornecem informações sobre a genética básica estrutural do loco CRISPR, relata a diversidade dos MGEs predatórios de P. aeruginosa, o que vem a contribuir com a geração de conhecimentos sobre o sistema CRISPR/Cas em P. aeruginosa.