Genômica populacional, conectividade e conservação do bonito listrado (Katsuwonus pelamis; Scombridae) no Oceano Atlântico

Abstract

O bonito listrado Katsuwonus pelamis, representa um dos recursos marinhos mais explorados ao redor do mundo, sendo a espécie de atum economicamente mais importante principalmente para as indústrias de enlatados. Durante este processo, ocorre a descaracterização morfológica, facilitando a ocorrência de fraudes. Apesar de a identificação das espécies ainda ser possível através do DNA, o processamento leva à degradação do material genético e a adição de diferentes substâncias dificulta a obtenção de um DNA de qualidade. O bonito listrado apresenta hábito migratório e distribuição cosmopolita, podendo ser encontrada em águas tropicais e subtropicais dos Oceanos Pacífico, Índico e Atlântico. De ciclo de vida rápido e alta fecundidade, sustenta altos tamanhos populacionais efetivos. Para fins de manejo, são considerados dois estoques pesqueiros no Oceano Atlântico coordenados pela ICCAT (Comissão Internacional para Conservação de Atuns do Atlântico): (1) Leste e (2) Oeste. Em termos de produtividade, o estoque Leste movimenta um volume significativamente maior de bonitos listrados (~ 271 mil toneladas em 2022) que o estoque Oeste (~21,4 mil toneladas em 2022). Entretanto, pouco se sabe acerca da conectividade genética entre essas regiões, o que pode comprometer o sucesso das estratégias de manejo atuais, principalmente em regiões com produtividade tão distintas. Desta forma, foi realizada uma revisão de literatura sobre os estudos genéticos do bonito listrado ao redor do mundo, indicando que, exceto pelo Oceano Índico, o bonito listrado apresenta populações altamente conectadas, havendo um gap de informação para o Oceano Atlântico. A estrutura populacional entre os dois estoques da espécie no Oceano Atlântico, definidos pela ICCAT, foi investigada a partir de dados genéticos [mitocondriais (região controle) e nucleares (íntron S7)] e genômicos (ddRADSeq). Quanto à estruturação genética, os resultados foram similares entre os marcadores, indicando altos níveis de conectividade tanto dentro do Atlântico Oeste e Leste quanto entre eles, com valores baixos e não significativos de FST, revelando que a espécie é composta por uma única população panmítica ao longo do Oceano Atlântico. A exceção foram as amostras da zona temperada, representada por Açores. Porém como os valores foram muito sutis, não há evidência para indicar um manejo separado. A biblioteca de 6271 SNPs, apresentou resultados similares aos marcadores de sequência. Por fim, foi testado um protocolo de pré-tratamento com a solução Phosphate Buffered Saline (PBS) para otimizar a qualidade do DNA extraído a partir de amostras de atum enlatados comercializados no Brasil. As amostras de atuns enlatados pré-tratadas

apresentaram valores significativamente maiores (p<0,01) tanto de concentrações de DNA (média de 59,28 ng/μL) quanto de pureza (A260/A280; média de 1,81), quando comparadas com aquelas que não passaram pelo pré-tratamento (concentração média de 9,67 ng/μL; A260/A280 média de 1,52). Além disso, foram obtidas PCRs para 8 das 13 amostras, com sequenciamento de 650 pb da região barcode COI para 4 delas. Todas as amostras sem pré-tratamento falharam. Estes resultados revelam uma resposta positiva ao tratamento proposto, sugerindo sucesso em remover substâncias utilizadas no processo de enlatamento.