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https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/52838
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Registro completo de metadados
Campo DC | Valor | Idioma |
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dc.contributor.advisor | GOMES, Elainne Christine de Souza | - |
dc.contributor.author | GONZAGA, Bárbara Silva | - |
dc.date.accessioned | 2023-10-10T19:35:16Z | - |
dc.date.available | 2023-10-10T19:35:16Z | - |
dc.date.issued | 2023-09-19 | - |
dc.date.submitted | 2023-10-09 | - |
dc.identifier.citation | GONZAGA, Bárbara Silva. Aplicação de Sm1-7qPCR para detecção de DNA de Schistosoma mansoni em modelo murino com infecção controlada. 2023. Trabalho de Conclusão de Curso (Biomedicina) - Universidade Federal de Pernambuco, Recife, 2023. | pt_BR |
dc.identifier.uri | https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/52838 | - |
dc.description.abstract | A esquistossomose é uma parasitose ocasionada pelo trematódeo Schistosoma spp., sendo a espécie S. mansoni prevalente no Brasil. O diagnóstico “padrão-ouro” para a doença é o teste parasitológico de Kato-Katz (KK), que identifica infectados e sua carga parasitária, porém apresenta pouca sensibilidade em áreas de baixa endemicidade. Por isso, o grande problema no contexto da saúde pública é a carência de métodos diagnósticos sensíveis que identifiquem pacientes assintomáticos e falso-negativos. Diante disso, a reação em cadeia de polimerase em tempo real (qPCR) pode ser promissora nessas localidades, devido à alta sensibilidade para detecção de pequenas quantidades de material genético. Para tanto, o objetivo deste estudo foi avaliar a aplicabilidade da Sm1-7qPCR na detecção de DNA de Schistosoma mansoni em amostras de camundongos. Assim, foram recolhidas individualmente, após 42 dias de infecção, as fezes de 15 camundongos expostos à infecção por S. mansoni e de 15 camundongos não infectados, estabelecidos como “não expostos”. As 30 amostras foram submetidas às técnicas de Hoffman e KK, e também foram utilizadas para comparação de dois métodos de extração de DNA: o kit comercial QIAamp Power Fecal® e o método in house de fenol:clorofórmio (FC); as análises das extrações de DNA foram realizadas por meio da absorbância A260/280, pelo espectrofotômetro. Além disso, foram realizadas diluições seriadas em fator 10 de DNA de vermes de S. mansoni para aplicação no sistema Sm1-7qPCR, a fim de se obter a sensibilidade analítica da técnica. O sistema de qPCR otimizado e a Nested-PCR foram utilizados sobre as amostras de DNA das fezes. Os resultados obtidos pelos testes diagnósticos foram analisados pelo software Stata 14, para obtenção dos dados epidemiológicos e de concordância (kappa). Os resultados revelaram melhores variações de absorbância (entre 1,87 e 1,9) para as DNAs extraídas por meio do kit comercial, sendo estes selecionados para aplicação no sistema Sm1-7qPCR. A otimização do sistema de qPCR obteve Ct de corte 35,32 para 1 fg/µL. A sensibilidade epidemiológica foi de 73,3% para Kato-Katz; 66,7% para Hoffman; e o mesmo valor de 86,7% para Nested-PCR e qPCR. A concordância comparada à infecção por cercária foi ótima para Sm1-7qPCR (𝛫 = 0,867; p < 0,001). Diante disso, as extrações obtidas por meio de kit comercial devem ser priorizadas para garantir o bom desempenho das técnicas moleculares aplicadas ao diagnóstico. Ademais, a Sm1-7qPCR se revelou como uma ferramenta útil para aplicação no diagnóstico da esquistossomose, uma vez que detectou a presença de S. mansoni em amostras biológicas em 13 dos 15 camundongos infectados. | pt_BR |
dc.description.sponsorship | FACEPE | pt_BR |
dc.format.extent | 57p. | pt_BR |
dc.language.iso | por | pt_BR |
dc.rights | openAccess | pt_BR |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ | * |
dc.subject | Esquistossomose | pt_BR |
dc.subject | Baixa endemicidade | pt_BR |
dc.subject | Extração de DNA | pt_BR |
dc.subject | Diagnóstico | pt_BR |
dc.subject | Carga parasitária | pt_BR |
dc.title | Aplicação de Sm1-7qPCR PARA DETECÇÃO DE DNA DE Schistosoma mansoni em modelo murino com infecção controlada | pt_BR |
dc.type | bachelorThesis | pt_BR |
dc.contributor.advisor-co | BARBOSA JÚNIOR, Walter Lins | - |
dc.contributor.authorLattes | http://lattes.cnpq.br/4099300903069220 | pt_BR |
dc.degree.level | Graduacao | pt_BR |
dc.contributor.advisorLattes | http://lattes.cnpq.br/7173069660592793 | pt_BR |
dc.description.abstractx | Schistosomiasis is a parasite caused by the trematode Schistosoma spp., the species S. mansoni being prevalent in Brazil. The “gold standard” diagnosis for the disease is the Kato-Katz (KK) parasitological test, which identifies infected people and their parasitic load, but has little sensitivity in areas of low endemicity. Therefore, the major problem in the context of public health is the lack of sensitive diagnostic methods that identify asymptomatic and false-negative patients. Given this, real-time polymerase chain reaction (qPCR) may be promising in these locations due to the high sensitivity for detecting small amounts of genetic material. Therefore, the objective of this study was to evaluate the applicability of Sm1-7qPCR in detecting Schistosoma mansoni DNA in mouse samples. Thus, feces were collected individually, after 42 days of infection, from 15 mice exposed to S. mansoni infection and from 15 uninfected mice, established as “not exposed”. The 30 samples were subjected to the Hoffman and KK techniques, and were also used to compare two DNA removal methods: the commercial QIAamp Power Fecal® kit and the in-house phenol:chloroform (FC) method; DNA extraction analyzes were carried out using absorbance A260/280, using a spectrophotometer. In addition, serial dilutions of S. mansoni worm DNA were carried out in factor 10 for application in the Sm1-7qPCR system, in order to obtain the analytical sensitivity of the technique. The optimized qPCR system and Nested-PCR were used on stool DNA samples. The results obtained by the diagnostic tests were analyzed using Stata 14 software, to obtain epidemiological and agreement data (kappa). The results revealed better absorbance variations (between 1.87 and 1.9) for the DNAs extracted using the commercial kit, which were selected for application in the Sm1-7qPCR system. The optimization of the qPCR system obtained a cutoff Ct of 35.32 for 1 fg/µL. Epidemiological sensitivity was 73.3% for Kato-Katz; 66.7% for Hoffman; and the same value of 86.7% for Nested-PCR and qPCR. The agreement compared to Cercariae infection was excellent for Sm1-7qPCR (𝛫 = 0.867; p < 0.001). Therefore, extractions obtained using a commercial kit must be prioritized to ensure the good performance of molecular techniques applied to diagnosis. Furthermore, Sm1-7qPCR proved to be a useful tool for use in the diagnosis of schistosomiasis, as it detected the presence of S. mansoni in biological samples in 13 of the 15 infected mice. | pt_BR |
dc.subject.cnpq | Áreas::Ciências Biológicas::Parasitologia | pt_BR |
dc.degree.departament | ::(CB-DBM) - Departamento de Biomedicina | pt_BR |
dc.degree.graduation | ::CB-Curso de Biomedicina | pt_BR |
dc.degree.grantor | Universidade Federal de Pernambuco | pt_BR |
dc.degree.local | Recife | pt_BR |
dc.contributor.advisor-coLattes | http://lattes.cnpq.br/2536101767444787 | pt_BR |
dc.identifier.orcid | https://orcid.org/0000-0001-6271-1535 | pt_BR |
Aparece nas coleções: | (CB - BM) - TCC - Biomedicina |
Arquivos associados a este item:
Arquivo | Descrição | Tamanho | Formato | |
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