Distribuição e prevalência de elementos não codificantes em Glycine Willd. Vigna Savi

Abstract

A genômica comparativa tornou-se uma importante área de pesquisa nos últimos anos, após a disponibilização de um número de genomas total ou parcialmente sequenciados, permitindo uma visão detalhada da organização de regiões gênicas ou não codificantes. A comparação dos genomas é de grande importância para a análise das regiões funcionalmente relevantes, permitindo também inferências sobre a evolução e os mecanismos que conduzem ao rearranjo de cariótipos, havendo importantes implicações práticas, principalmente quando são comparadas espécies cultivadas e seus parentes silvestres, potencialmente doadores de genes para o melhoramento. Este trabalho teve o objetivo de realizar um estudo citogenético e comparativo de espécies dos gêneros Glycine e Vigna. Para isso foram utilizadas três abordagens: Uma análise citogenômica comparativa mediante localização in situ de oligonucleotídeos com padrão de microssatélites [(AAC)5, (AAG)5, (ACC)5, (AG)8 (CTC)5, (TGA)6] ao longo dos cromossomos de Glycine soja e G. tomentella. Nesta etapa, foram observadas regiões de marcação mais intensa em alguns cromossomos, embora a maioria dos oligonucleotídeos tenha apresentado distribuição dispersa nos genomas analisados. Uma segunda abordagem avaliou a distribuição de domínios RT do retrotransposons Ty1- copia-like, nos cromossomos de Vigna umbellata, V. sesquipedalis e V. aconitifolia, apresentando uma distribuição dispersa e sinais proximais destes elementos nem determinados cromossomos. Em uma terceira abordagem, foi realizada uma investigação do elemento transponível CACTA no genoma da soja (Glycine max), mediante análise in silico. Neste estudo, foram identificados domínios transposase do elemento citado, compreendendo 10 Mb de Tnp1, 2,2 Mb de Tnp2, bem como domínios de outras transposases não relacionados diretamente ao elemento CACTA, mostrando que a diversidade e abrangência destes elementos é maior do que reportado até então. Considerando-se que microssatélites e retrotransposons são importantes componentes dos genomas em espécies da tribo Phaseoleae, os resultados aqui obtidos trazem interessantes evidências sobre o papel estrutural e funcional dessas sequências repetitivas.