Variações do número de cópias gênicas e suas mudanças na expressão gênica em vias moleculares da leucemia mielóide aguda

Abstract

As Variantes do Número de Cópias, identificadas com a sigla em inglês CNVs, são variações em segmentos de DNA caracterizados por ganho ou perda de material genético. Sua principal consequência está em alterar os níveis dos produtos de expressão de genes afetados. Diferentes estudos demonstraram a correlação entre essas alterações e a expressão de RNA para diferentes cânceres. Neste estudo, foi desenvolvido uma ferramenta que auxilia o processamento e análise de CNVs, e em posterior demonstrou-se a correlação entre aquelas variantes e a expressão dos genes contidos nestas variantes na Leucemia Mielóide Aguda (LMA). Também demonstramos a expressão diferencial de genes contendo CNVs, que participam de vias responsáveis pelo controle da proliferação celular, vantagem seletiva e sobrevivência celular. Destacam-se, em especial, os genes FLT3, KIT, RAS, JAK, STAT e PDGFs. Os resultados das análises foram anotados por enriquecimento de vias biológicas para melhor representação e interpretação das consequências daquelas alterações no contexto da LMA. Os algoritmos computacionais utilizados nessa análise, escritos na linguagem de programação R, constituem a biblioteca denominada CNeEXp disponibilizada em <https://github.com/brunorsci/CNeEXP>.