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https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/44658
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Registro completo de metadados
Campo DC | Valor | Idioma |
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dc.contributor.advisor | SIMAS, Alfredo Mayall | - |
dc.contributor.author | MUNGUBA, Gabriel Henrique Lima | - |
dc.date.accessioned | 2022-06-07T13:25:59Z | - |
dc.date.available | 2022-06-07T13:25:59Z | - |
dc.date.issued | 2022-05-10 | - |
dc.date.submitted | 2022-06-07 | - |
dc.identifier.uri | https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/44658 | - |
dc.description.abstract | Complexos de íons lantanídeos apresentam uma grande variedade de números de coordenação, desde três, até os maiores como doze, sendo oito e nove os mais comuns. Incrementos nestes números de coordenação, entretanto, podem levar a uma explosão combinatória no número de estereoisômeros de coordenação, incluindo o aparecimento de inúmeros pares de enantiômeros; todos, em princípio, estruturas iniciais válidas para cálculos mais sofisticados de modelagem molecular. Para obter todas estas geometrias iniciais, foi desenvolvido o Complex Build Software, que produz, mediante o algoritmo Complex Build, conjuntos completos de geometrias de complexos de lantanídeos, pré-otimizados, com controle de suas estereoisomerias (incluindo também o reconhecimento da quiralidade de coordenação). O algoritmo considera características químicas e topológicas próprias dos ligantes, como graus de liberdades, denticidade, simetria, reconhecimento de ciclos aromáticos, etc, e também introduz um novo potencial interligante chamado Crowding. A minimização do Crowding com respeito aos graus de liberdade, sob restrições de forma e grupo pontual do poliedro de coordenação, leva à geometria final. Estas geometrias são geradas na forma de arquivos de entrada, prontos para serem submetidos a outros programas de Química Computacional, como ORCA, Gaussian, MOPAC, LUMPAC, Gamess, JOYSpectra, etc. Após as subsequentes otimizações pelos métodos mais sofisticados, as estruturas produzidas a partir do Complex Build convergem para geometrias finais sem a presença de frequências vibracionais imaginárias, como foi constatado para a ampla maioria dos casos, o que é um indicativo de que correspondem a um mínimo local verdadeiro na superfície de energia potencial. Ao comparar as estruturas otimizadas para um dado complexo, tanto a partir de uma estrutura cristalográfica quanto a partir da estrutura produzida pelo Complex Build, se constata que ambas são tão parecidas que levam a diferenças entre suas entalpias de formação calculadas, em valores absolutos, normalmente menores que 1,0 kcal/mol, o que é suficiente para muitas aplicações. Comprovou-se assim, que os algoritmos de construção de complexos com controle estereoquímico desenvolvidos para o Complex Build levam de fato à produção de boas geometrias de partida. A metodologia do Complex Build é, portanto, válida para qualquer centro metálico, embora até o momento esteja disponível com maior exatidão apenas para centros formados por íons de metais lantanídeos. | pt_BR |
dc.description.sponsorship | CAPES | pt_BR |
dc.format.extent | 201 p. | pt_BR |
dc.language.iso | por | pt_BR |
dc.rights | openAccess | pt_BR |
dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil | * |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ | * |
dc.subject | estereoisomeria | pt_BR |
dc.subject | quiralidade de coordenação | pt_BR |
dc.subject | complexos de lantanídeos | pt_BR |
dc.subject | otimização de geometria | pt_BR |
dc.subject | software de modelagem molecular | pt_BR |
dc.subject | stereoisomers | pt_BR |
dc.subject | coordination chirality | pt_BR |
dc.subject | lanthanoid complexes | pt_BR |
dc.subject | geometry optimization | pt_BR |
dc.subject | molecular modelling software | pt_BR |
dc.title | COMPLEX BUILD: um novo software para a construção de complexos de íons Lnn+ com controle estereoquímico | pt_BR |
dc.type | bachelorThesis | pt_BR |
dc.contributor.advisor-co | CARVALHO, Gabriel Aires Urquiza de | - |
dc.contributor.authorLattes | http://lattes.cnpq.br/4972475832823046 | pt_BR |
dc.degree.level | Graduacao | pt_BR |
dc.contributor.advisorLattes | http://lattes.cnpq.br/9496835605175510 | pt_BR |
dc.description.abstractx | Lanthanoid ion complexes display a vast range of coordination numbers, from three, to larger ones, as high as twelve, with eight and nine being the most common. Increments in these coordination numbers can lead to a combinatorial explosion in the number of coordination stereoisomers, encompassing innumerous enantiomeric pairs, all of them, in principle, valid initial structures for more sophisticated molecular modeling studies. In order to obtain all these initial geometries, the Complex Build Software was developed, which outputs, using the Complex Build Algorithm: complete sets of pre-optimized lanthanoid complexes geometries with stereochemical control, including the recognition of coordination chirality. The Complex Build Algorithm considers chemical and topological characteristics of the ligands, such as degrees of freedom, denticity, symmetry, aromatic cycles recognition, etc, and also introduces a new inter-ligand potential called Crowding. Crowding minimization with respect to the ligands’ degrees of freedom, under coordination polyhedron shape and point group constraints, leads to the final geometry. These geometries are generated in the form of input files, ready to be submitted to other computational chemistry softwares, such as ORCA, Gaussian, MOPAC, LUMPAC, Gamess, JOYSpectra, etc. After subsequent optimizations by more sophisticated methods, the structures produced from the Complex Build Software converge to final geometries without the presence of imaginary vibrational frequencies, as was found for the majority of cases, which is an indication that they correspond to true minima on the potential energy surface. When comparing the optimized structures for a given complex, both from a crystallographic structure and from the structure produced by Complex Build, it appears that both are so similar that they lead to differences between their calculated enthalpies of formation, usually less than 1.0 Kcal/mol, which is sufficient for most applications. Therefore, it was proved that the Complex Build Algorithm actually leads to the production of good quality starting geometries with full stereochemical control. Although the Complex Build methodology has been conceived to be valid for any metallic center, in its present implementation, it is available with greater accuracy only for lanthanoid metal ion centers. | pt_BR |
dc.subject.cnpq | Áreas::Ciências Exatas e da Terra::Química | pt_BR |
dc.degree.departament | ::(CCEN-DQF) - Departamento de Química Fundamental | pt_BR |
dc.degree.graduation | ::CCEN-Curso de Química (Bacharelado e Licenciatura) | pt_BR |
dc.degree.grantor | Universidade Federal de Pernambuco | pt_BR |
dc.degree.local | Recife | pt_BR |
dc.contributor.advisor-coLattes | http://lattes.cnpq.br/5144449770910610 | pt_BR |
Aparece nas coleções: | (TCC) - Química (Bacharelado) |
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Arquivo | Descrição | Tamanho | Formato | |
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